Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NME5P56597 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NME5P56597 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NME5P56597 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms