Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AP1S2P56377 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms