Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OXCT1P55809 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms