Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCR5P51681 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCR5P51681 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCR5P51681 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms