Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BRCA2P51587 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRCA2P51587 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRCA2P51587 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRCA2P51587 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRCA2P51587 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRCA2P51587 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BRCA2P51587 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms