Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSEN1P49768 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms