Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NESP48681 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NESP48681 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NESP48681 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NESP48681 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NESP48681 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NESP48681 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NESP48681 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NESP48681 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NESP48681 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NESP48681 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NESP48681 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NESP48681 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NESP48681 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NESP48681 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NESP48681 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NESP48681 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NESP48681 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NESP48681 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NESP48681 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NESP48681 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NESP48681 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms