Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME1P48163 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME1P48163 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME1P48163 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME1P48163 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms