Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIA2P42262 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms