Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARL1P40616 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms