Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PPARGP37231 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPARGP37231 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPARGP37231 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms