Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTNNB1P35222 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTNNB1P35222 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.1 ms