Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNA1P35221 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms