Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERPINB3P29508 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms