Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRB3P28472 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms