Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNMT1P26358 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms