Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPREP23469 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPREP23469 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPREP23469 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPREP23469 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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