Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRCP23327 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HRCP23327 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRCP23327 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRCP23327 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRCP23327 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms