Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CALB2P22676 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CALB2P22676 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms