Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRHP20396 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRHP20396 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRHP20396 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRHP20396 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TRHP20396 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TRHP20396 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRHP20396 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRHP20396 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms