Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDSP20132 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDSP20132 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SDSP20132 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms