Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGB6P18564 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms