Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GM2AP17900 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GM2AP17900 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GM2AP17900 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GM2AP17900 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GM2AP17900 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GM2AP17900 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GM2AP17900 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GM2AP17900 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GM2AP17900 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GM2AP17900 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GM2AP17900 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GM2AP17900 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GM2AP17900 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GM2AP17900 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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