Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNNT1P13805 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms