Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH1P12830 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH1P12830 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH1P12830 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH1P12830 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH1P12830 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH1P12830 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH1P12830 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH1P12830 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH1P12830 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH1P12830 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH1P12830 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH1P12830 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH1P12830 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms