Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BMP3P12645 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP3P12645 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP3P12645 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP3P12645 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP3P12645 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BMP3P12645 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMP3P12645 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMP3P12645 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMP3P12645 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMP3P12645 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMP3P12645 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMP3P12645 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMP3P12645 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMP3P12645 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMP3P12645 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMP3P12645 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMP3P12645 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMP3P12645 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BMP3P12645 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms