Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms