Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHGAP10645 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHGAP10645 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHGAP10645 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHGAP10645 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHGAP10645 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHGAP10645 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHGAP10645 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHGAP10645 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHGAP10645 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHGAP10645 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHGAP10645 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms