Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBP1P09455 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP1P09455 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP1P09455 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms