Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms