Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HLA-DQB1P01920 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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