Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN9O95484 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN9O95484 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN9O95484 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms