Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms