Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CALUO43852 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CALUO43852 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALUO43852 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALUO43852 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALUO43852 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALUO43852 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CALUO43852 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALUO43852 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALUO43852 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALUO43852 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALUO43852 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CALUO43852 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CALUO43852 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms