Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
USP9YO00507 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
USP9YO00507 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
USP9YO00507 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USP9YO00507 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USP9YO00507 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USP9YO00507 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USP9YO00507 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
USP9YO00507 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
USP9YO00507 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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