Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms