Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
E9PBE3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
E9PBE3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
E9PBE3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms