Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PATL2C9JE40 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms