Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC144AA2RUR9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC144AA2RUR9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms