Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SATB2Q9UPW6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188 ms