Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFMBT1Q9UHJ3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFMBT1Q9UHJ3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms