Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MBD5Q9P267 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms