Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MIS18AQ9NYP9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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MIS18AQ9NYP9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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MIS18AQ9NYP9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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MIS18AQ9NYP9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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MIS18AQ9NYP9 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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MIS18AQ9NYP9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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MIS18AQ9NYP9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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MIS18AQ9NYP9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MIS18AQ9NYP9 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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