Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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