Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBRD1Q9NUN5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms