Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTNNBIP1Q9NSA3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms