Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB6BQ9NRW1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms