Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00597Q9H2U6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms