Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCSER1Q9C0I3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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