Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP74Q9C0B2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP74Q9C0B2 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms